การรักษาด้วยยาต้านจุลชีพที่ประสบความสำเร็จจำเป็นต้องเลือกใช้ยาปฏิชีวนะที่เหมาะสม รวมถึงขนาดยา ความถี่ และระยะเวลา มาตรฐานทองคำสำหรับการวินิจฉัย UTI คือการเพาะเชื้อในปัสสาวะ ตามหลักการแล้ว ผู้ป่วยทุกรายที่สงสัยว่าติดเชื้อ UTI ควรเก็บตัวอย่างปัสสาวะผ่านการตรวจด้วยซิสโตเซนเทซิส และประเมินโดยการเพาะเชื้อแบบแอโรบิกและการทดสอบความไวต่อยาปฏิชีวนะ เลี้ยงสัตว์ เทคนิคที่ใช้ในการพิจารณาความไวต่อยาปฏิชีวนะ ได้แก่ การแพร่กระจายของดิสก์และการเจือจางยาปฏิชีวนะแบบอนุกรม วิธีการที่พึงประสงค์คือการเจือจางยาต้านจุลชีพแบบอนุกรม ซึ่งให้ความเข้มข้นต่ำสุดในการยับยั้ง (MIC) ของยาปฏิชีวนะ ในขณะที่การแพร่กระจายของดิสก์ถือว่ามีความน่าเชื่อถือน้อยกว่าและไม่ได้ให้ MIC