ความก้าวหน้าในการกำหนดเป้าหมายไวรัสทั้งระดับโมเลกุลและระดับเซลล์ของการติดเชื้อเอชไอวียังนำไปสู่การค้นพบที่สำคัญซึ่งช่วยให้เราเข้าใจระยะต่างๆ ของการติดเชื้อได้ดีขึ้น ตลอดจนเหตุการณ์ที่นำไปสู่การเกิดภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่อง ตัวรับของเซลล์สำหรับ HIV และ SIV คือโมเลกุล CD4 บนทีเซลล์และเซลล์เชื้อสายโมโนไซต์ โรคเอชไอวี มาโครฟาจพร้อมกับตัวรับเคมีโมไคน์ โดยทั่วไป CCR5 และ CXCR4 นมนุษย์ การติดเชื้อมักเกิดขึ้นจากไวรัสที่ใช้ CCR5 ในการเข้าสู่เซลล์ แต่เมื่อเวลาผ่านไป